Zwischen 1980 und 2006 wurde die Art am Klingnauer Stausee in 4 Jahren mit je 1 Ind. nachgewiesen, nämlich am 25. und 28. April 1982, am 29. Juli 1982, am 22. April 1985 und am 22. April 1992.
In den Jahren zuvor wurden Seggenrohrsänger etwas häufiger beobachtet. Insgesamt liegen zwischen 1941 und 1980 rund ein Dutzend Meldungen vor, so beispielsweise 4 Ind. am 23. August 1964 oder 3 Ind. am 9. August 1959. Es ist auffallend, dass beinahe alle Beobachtungen aus dem Herbstzug stammen.
Analog zu diesem Befund hat sich sowohl der Schweizer als auch der europäische Bestand abnehmend entwickelt. Der Seggenrohrsänger brütet heute noch hauptsächlich in Polen.